Die Bürgerstiftung Bonn führt die Geschäfte des gemeinnützigen Vereins für Bonner Stiftungen, der im Frühjahr 2007 anlässlich des 1. Bonner Stiftungstages gegründet wurde.
Zweck des Vereins für Bonner Stiftungen ist die aktive Förderung des Stiftungsgedankens in der Region Bonn. Hierfür hat sich der Verein unter anderem das Ziel gesetzt, alle drei Jahre den Bonner Stiftungstag zu initiieren. Außerdem setzt sich der Verein für eine stärkere Vernetzung und Kooperation zwischen den über 180 rechtsfähigen Bonner Stiftungen ein.